Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh13Q8CEE7 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms