Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CntrobQ8CB62 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms