Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cwc22Q8C5N3 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms