Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdac7Q8C2B3 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdac7Q8C2B3 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms