Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms