Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ttc29Q80VM3 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms