Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Pkp4Q68FH0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Pkp4Q68FH0 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Pkp4Q68FH0 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pkp4Q68FH0 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
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