Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc18Q640L5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Ccdc18Q640L5 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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Ccdc18Q640L5 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Ccdc18Q640L5 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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