Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BcanQ61361 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BcanQ61361 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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BcanQ61361 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BcanQ61361 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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BcanQ61361 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BcanQ61361 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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BcanQ61361 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BcanQ61361 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BcanQ61361 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BcanQ61361 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BcanQ61361 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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