Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BB287469Q3UT53 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
BB287469Q3UT53 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
BB287469Q3UT53 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
BB287469Q3UT53 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
BB287469Q3UT53 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
BB287469Q3UT53 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
BB287469Q3UT53 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
BB287469Q3UT53 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
BB287469Q3UT53 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
BB287469Q3UT53 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
BB287469Q3UT53 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
BB287469Q3UT53 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
BB287469Q3UT53 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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BB287469Q3UT53 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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BB287469Q3UT53 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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BB287469Q3UT53 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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BB287469Q3UT53 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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BB287469Q3UT53 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
BB287469Q3UT53 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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