Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms