Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Puf60Q3UEB3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms