Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Shcbp1lQ3TTP0 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms