Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Treml4Q3LRV9 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms