Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3ip1Q149C2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms