Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 1110025M09Rik-201ENSMUST00000192082 855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 AC160991.2-201ENSMUST00000223784 1135 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 AC154640.1-204ENSMUST00000227105 648 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox12Q04890 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm9553-201ENSMUST00000185703 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox12Q04890 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms