Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja5Q01231 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms