Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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