Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm31182-201ENSMUST00000219061 2391 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm37145-201ENSMUST00000193540 2756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Stard3nl-205ENSMUST00000197565 1391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Zfp740-205ENSMUST00000121206 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm28309-201ENSMUST00000136302 623 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm25426-201ENSMUST00000157606 170 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm17197-201ENSMUST00000163160 452 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm26913-201ENSMUST00000182391 732 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm2981-201ENSMUST00000213947 694 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Pcbd1-202ENSMUST00000218005 361 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Sh2d1a-201ENSMUST00000005839 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Prss23-204ENSMUST00000207932 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm17250-201ENSMUST00000180494 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm26639-201ENSMUST00000181426 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 1700102F20Rik-201ENSMUST00000203859 670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Gm40723-201ENSMUST00000219407 603 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Figla-201ENSMUST00000032070 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PtprmP28828 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Nbdy-204ENSMUST00000185492 1346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Rpusd4-201ENSMUST00000034543 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 4933406K04Rik-201ENSMUST00000124068 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Vmn2r-ps7-201ENSMUST00000176244 1098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Pon1-203ENSMUST00000176945 619 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm4398-201ENSMUST00000182698 992 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Arl15-202ENSMUST00000224068 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm26205-201ENSMUST00000082907 134 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Deup1-203ENSMUST00000115593 3019 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtprmP28828 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtprmP28828 Tes-201ENSMUST00000076654 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms