Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Kif5cP28738 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Kif5cP28738 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Kif5cP28738 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Kif5cP28738 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kif5cP28738 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kif5cP28738 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kif5cP28738 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kif5cP28738 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Kif5cP28738 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Kif5cP28738 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms