Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RxraP28700 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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