Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms