Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm5742-201ENSMUST00000120764 505 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Med6-205ENSMUST00000161598 897 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Tatdn3-202ENSMUST00000085633 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Spred1-202ENSMUST00000110901 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxb4P10284 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms