Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Map2-206ENSMUST00000114017 4981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TtrP07309 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TtrP07309 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TtrP07309 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TtrP07309 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TtrP07309 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TtrP07309 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TtrP07309 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TtrP07309 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TtrP07309 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TtrP07309 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TtrP07309 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms