Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms