Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XntrpcF8VQM8 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms