Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf169E9Q7F2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf169E9Q7F2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf169E9Q7F2 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf169E9Q7F2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf169E9Q7F2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf169E9Q7F2 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf169E9Q7F2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf169E9Q7F2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf169E9Q7F2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf169E9Q7F2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf169E9Q7F2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf169E9Q7F2 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf169E9Q7F2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf169E9Q7F2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf169E9Q7F2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf169E9Q7F2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rnf169E9Q7F2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf169E9Q7F2 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf169E9Q7F2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf169E9Q7F2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf169E9Q7F2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf169E9Q7F2 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf169E9Q7F2 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf169E9Q7F2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rnf169E9Q7F2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rnf169E9Q7F2 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf169E9Q7F2 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rnf169E9Q7F2 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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