Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Serpini2-201ENSMUST00000039047 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm2541-201ENSMUST00000161209 711 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm37306-201ENSMUST00000193447 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Speer3W4VSP1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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