Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CcniQ9Z2V9 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms