Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm21943-201ENSMUST00000178181 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm7684-201ENSMUST00000211891 829 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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SrfQ9JM73 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SrfQ9JM73 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms