Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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