Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
OtofQ9ESF1 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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