Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms