Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ptp4a3Q9D658 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ptp4a3Q9D658 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ptp4a3Q9D658 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ptp4a3Q9D658 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ptp4a3Q9D658 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ptp4a3Q9D658 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ptp4a3Q9D658 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms