Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Wdr55Q9CX97 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Wdr55Q9CX97 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms