Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddx28Q9CWT6 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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