Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Fhod1-201ENSMUST00000014922 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Zic3-201ENSMUST00000088627 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Nicn1Q9CQM0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.9 ms