Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQB7

Lyrm1, LYR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyrm1Q9CQB7 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lyrm1Q9CQB7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211.3 ms