Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Usp11Q99K46 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Usp11Q99K46 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Usp11Q99K46 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Usp11Q99K46 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Usp11Q99K46 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Usp11Q99K46 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Usp11Q99K46 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp11Q99K46 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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