Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf144aQ925F3 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms