Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc63Q8CDV6 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms