Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf428Q8C1M2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Znf428Q8C1M2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Znf428Q8C1M2 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Znf428Q8C1M2 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Znf428Q8C1M2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Znf428Q8C1M2 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Znf428Q8C1M2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf428Q8C1M2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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