Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms