Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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FarsaQ8C0C7 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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FarsaQ8C0C7 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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FarsaQ8C0C7 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
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FarsaQ8C0C7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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FarsaQ8C0C7 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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FarsaQ8C0C7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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FarsaQ8C0C7 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
FarsaQ8C0C7 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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