Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChfrQ810L3 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms