Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ckap2lQ7TS74 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ckap2lQ7TS74 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms