Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssx9Q6XAS3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms