Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 H2al1m-201ENSMUST00000073949 535 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm17033-201ENSMUST00000146663 593 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ccdc28a-205ENSMUST00000174592 882 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm42402-201ENSMUST00000208341 1054 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm29266-201ENSMUST00000190392 600 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm15860-203ENSMUST00000197262 360 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NipblQ6KCD5 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms