Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtprdQ64487 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms