Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm43615-201ENSMUST00000197465 1773 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Irf2-201ENSMUST00000034041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms